吉林農業大學農學院是1948年吉林農業大學建校時成立的最早院系之一。現有教職工90人，其中教師82人，師資力量雄厚，是一支學歷層次較高、學術造詣較深、思想活躍、富于創新的學術隊伍。

師資隊伍中具有碩士以上學歷的占85.3%，博士學位獲得者占44.1%以上。師資隊伍中教授14人，副教授30人，博士生導師7人，碩士生導師28人。俄羅斯農業科學院院士1人、蒙古國自然科學院外籍院士1人，國家級有突出貢獻的專家1人，省級有突出貢獻的專家3人，享受國務院政府特殊津貼5人，國務院學科評審組成員1人，吉林省跨世紀學術帶頭人6人。農學院在讀本專科生899人，碩士研究生180人，博士研究生28人。

農學院下設農學、植物保護兩個系,作物栽培等8個教研室，以及院辦和學生工作辦公室行政機構。農學院非常重視專業和學科建設，現有作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種學、植物病理學、菌類作物學和農業昆蟲和害蟲防治5個碩士學位授權2級學科；作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種學和植物病理學和菌類作物學4個博士學位授予2級學科，作物學一級博士學位授權學科，并建立了博士后流動站。其中作物栽培學與耕作學為農業部和省級重點學科，作物遺傳育種學和植物病理學為省級重點學科。農學院建設有教育部食藥用菌產業化工程中心、吉林省大豆區域創新中心，設有菌物、水稻、特用玉米和農業生物技術4個研究機構和3個一級實驗室，擁有谷物分析儀、光合作用測定系統、高速冰凍離心機等現代教學、科研儀器設備，儀器設備總值達到900萬元，生均設備值1萬元，為教學和科研提供了充分的保障。

農學院堅持以教學工作為中心，以學生為主體，全面推進素質教育，不斷提高教學水平和人才培養質量。《植物生理學》課程被確定為省級建設精品課程，《作物遺傳育種學》程被評為省級優秀課程，獲得國家級教學改革研究成果獎一等獎1項，獲得優秀教學成果省級一等獎2 項，國家二等獎1項。建立了完善的實驗教學體系和30多個穩固的校外實踐教學基地。“十五”期間，應屆本科畢業生考取碩士研究生的比率達30%以上。近三年，碩士研究生的博士生考取率達50%以上。本科畢業生就業率一直保持在95%以上。同時農學院重視學生綜合素質的提高，成立了昆蟲學社、蘑菇愛好者協會等專業性學生社團組織，為學生的鍛煉提供了舞臺。

農學院科學研究與科技推廣碩果累累。“九五”以來，農學院承擔國家、省部級項目100余項，獲國家、省部級獎勵60余項，培育農作物新品種40余個，出版學術專著60多部，發表學術論文800余篇。農學院響應學校 “把論文寫在吉林大地上”的辦學理念，積極投身于吉林省地方經濟建設，先后主持并完成了“高效農業科技示范區”、“省長豐產方”、“玉米大面積豐產栽培”和國家農發辦“現代化農林示范”等項目，為地方經濟的發展做出了貢獻，農學院先后獲得“科研管理工作先進學院”等榮譽稱號。

農學院十分重視國際交流與合作，先后與美國、俄羅斯、荷蘭、日本、韓國、澳大利亞、加拿大、哥倫比亞、厄瓜多爾、加納、羅馬尼亞等10多個國家的高校、科研機構開展學術交流與合作， 2001年，農學院成為由國際熱帶農業研究中心（CIAT）、福特基金會（FD）和加拿大國際發展研究中心（IDRC）支持的“以農民為中心”的12個“參與式教學模式”研究網絡單位之一，2006年建立“中俄菌類資源保育與研究中心”，長期開展國際項目研究和學術交流。

農學院正積極加強現代生物技術、農業工程技術與傳統學科的滲透交叉，以提升傳統優勢學科水平。同時狠抓人才培養和學科建設，以本科教育為基礎，大力發展研究生教育。