南京工業大學土木工程學院源自同濟醫工學堂，辦學歷史可追溯到1915年。1933年建同濟高工，1951年遷至南京，1980年更名為南京建筑工程學院，2001年與原南京化工大學年合并組建南京工業大學后，原土木工程系更名為土木工程學院。2010年8月，土木工程學院部分學科專業和工程管理專業聯合組建了現在的土木工程學院。在百年的辦學歷程中，土木工程學院建成了包括學士、碩士、博士、博士后在內的完整的人才培養體系，向社會輸送了2萬余名畢業生，得到社會各界的普遍歡迎和高度評價。

土木工程學院現有土木工程本科專業。該專業為江蘇省首批特色專業，2011年5月順利通過了第三次專業評估，獲得了8年有效期，成為全國第17個獲此殊榮的高校。土木工程專業是國家特色專業建設點、國家卓越工程師教育培養計劃首批試點專業。土木工程學院擁有土木工程一級學科博士后流動站，土木工程一級學科博士點，土木工程、建筑與土木工程領域等專業學位點。土木工程學院擁有江蘇省土木工程與防災減災重點實驗室、學校建設標準國家研究中心、江蘇省綠色建筑工程技術研究中心、南京工業大學綠色建筑產業科技園等重要學科平臺。

土木工程學院目前在校本科生1800余名，全日制研究生近600名，工程碩士近200名。土木工程學院現有教職工100人，其中顧問及雙聘院士4人，“長江學者”特聘教授1名，國家自然科學基金委杰出青年基金（海外）獲得者1名；省部級優秀工作者3人，江蘇省有突出貢獻的中青年專家1人，江蘇省教學名師1人，江蘇省333人才計劃獲得者4名，江蘇省“六大”高峰人才7人，江蘇省“青藍工程”中青年學術帶頭人和優秀青年骨干教師6人，江蘇省雙創博士1名；南京工業大學“工大才俊”2人。國家外專局高端外籍專家2名，形成了老中青相結合、學歷層次較高、學緣結構和知識結構較為合理的師資隊伍。

土木工程學院緊密結合國家建設需要開展科學研究和科技服務，在結構抗震減震及綜合防護、綠色建筑與建筑節能、鋼結構及組合結構、復合材料結構、竹木及工程復合木結構、橋梁工程、工程管理、房地產經營等方面已形成了特色，完成了一批有重要影響的重大項目。近五年獲得包括國家自然科學基金重點項目、國家973項目、國家863項目在內的各類基金項目200余項，科研經費超億元；獲得了包括國家科技進步二等獎、國家高等教育教學成果一等獎、二等獎、江蘇省科技進步一等獎、二等獎，江蘇省高等教育教學成果一等獎、二等獎、黑龍江省科技進步一等獎在內的多項科技獎勵，多項科技成果在杭州灣跨海大橋、昆明新國際機場航站樓、南京地鐵等重大工程中得到重要應用。

土木工程學院正圍繞學校 “綜合性、研究型、全球化”高水平大學的宏偉目標，本著“培育卓越人才，服務家國社會，崇尚學術自由，學問世界水平”的辦院理念，凝心聚力謀發展，開拓創新上層次，乘勢而上求跨越，力爭在10年內實現“世界知名，中國卓越”到“世界著名，中國一流”的戰略目標。