經濟學院目前設有經濟學系、國際經濟貿易系、金融與保險學系、產業經濟學系4個系和人口研究所。經濟學院是國家級2011計劃“中國特色主義經濟建設協同創新中心”的主要參與單位，是江蘇省2011計劃“區域經濟轉型與管理變革協同創新中心”的牽頭單位，擁有國家教育部人文社會科學百所重點研究基地“南京大學長江三角洲經濟社會發展研究中心”、國家文化部重點研究基地“南京大學文化產業研究所”、還擁有兩個“江蘇決策咨詢研究基地”，擁有1個江蘇省哲學社會科學研究基地“蘇南率先基本實現現代化研究中心”等研究機構，以及國家985哲學社會科學創新平臺“經濟發展與轉型研究中心”和國家級經濟學基礎人才培養基地。經濟學院擁有理論經濟學和應用經濟學一級學科博士學位授予權，有本科專業5個，碩士點（含人口研究所）9個，二級學科博士點8個，博士后流動站2個，國家重點學科1個，國家重點培育學科1個，江蘇省一級重點學科2個。

經濟學院擁有一批具有國外留學背景、學術水平較高、年富力強、團結奮進的師資隊伍。現有教師77名，海外博士學位獲得者 18人,教授36人，副教授23人，其中教育部社會科學委員會委員2人（副主任委員1名），國務院學科評議組成員1人，教育部教學指導委員會委員2人，教育部長江學者特聘教授4人，國家級教學名師3人，教育部新世紀人才7人。在科學研究方面，經濟學院經獲得國家人文社會科學成果獎二等獎4次，三等獎1次；江蘇省哲學社會科學優秀研究成果獎一等獎10多次、并有4人先后獲得全國經濟學界最高獎-孫冶方經濟科學獎。另外，有4人獲得過“全國百篇優秀博士論文獎”，2人獲得了“黃達-蒙代爾”學術獎，1人獲得張培剛發展經濟學獎，1人獲得劉詩白經濟學獎。

在人才培養方面，強調“加強基礎，注重應用，培養能力，提高素質”，培養了一大批深受社會歡迎的經濟專門人才。近些年，經濟學院努力改革課程體系和教學方法，積極引進海外名校教授講授系列的、先進的經濟學課程；與校內其他院系進行聯合培養試點；開展了豐富的學術活動。經濟學系與國際貿易系是教育部“教育部高等學校特色專業建設點”與“江蘇省重點專業”，經濟系還獲評“教育部人才培養模式創新實驗區”。經濟學院已經先后獲得教育部高等教育教學成果二等獎4次。

經濟學院致力于發揮智力優勢為社會服務，每年主辦“江蘇發展高層論壇”，邀請國內外高層次學者、政府官員、企業家參與，為江蘇的經濟發展、企業經營提供咨詢，被五任省委書記譽為“智力庫”、“參謀部”和“橋梁與紐帶”，每次論壇全省四套班子領導全部參加；與企業建立橫向聯系，承擔了多項科研項目，許多教師還受聘擔任省市及大企業的高級顧問，為地區經濟發展出謀劃策，已成為區域經濟發展和政府決策的智囊團。