中國農業大學農學與生物技術學院的前身是始建于清末的京師大學堂農科大學農學門，已經有102年的歷史。1949年由北京大學農學院、清華大學農學院、華北大學農學院相關院系合并組建為北京農業大學農藝學系、植物病理學系、昆蟲學系和園藝學系，并設置相應的本科專業。

1952年，隨著全國性的高等學校院系調整，將原來的系和專業調整為農學系（設農學專業）、園藝系（設果樹蔬菜、造園2專業）、植物保護系（設植物保護專業）。1958年，學校進行系和專業調整，調整為農學系（設農學專業、農業植物生理及生物化學專業、作物遺傳選種及良種繁育專業），園藝系（設果樹園林專業、蔬菜栽培專業），植物保護與農業微生物學系（設植物病理專業、農業昆蟲專業、農業微生物專業）。

1986年學校進行機構改革和院系調整，設農學系（農學專業、作物遺傳育種專業、農業氣象專業），園藝系（果樹專業、蔬菜專業、觀賞園藝專業），植物保護系（植物病理專業、農業昆蟲專業）。1995年學校將農學系、園藝系、植物保護系合并為植物科技學院，按照農學專業、作物遺傳育種專業、植物病理專業、農業昆蟲專業、果樹專業、蔬菜專業、觀賞園藝專業等專業招生培養。1999年，學校又將原農學系、園藝系、植物保護系分別調整為作物學院、植物保護學院和園藝學院。

中國農業大學農學與生物技術學院學專業、植物保護專業和園藝專業招生和培養，但具體按照作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種、植物病理學、昆蟲學、植保與植物檢疫、果樹學、蔬菜學等專業方向進行培養。2001年園藝學院新增園林專業、2002年作物學院新增種子科學與工程專業。