石河子大學機械電氣工程學院前身為1959年成立的兵團農學院農業機械化系。1996年9月石河子大學成立后更名為石河子大學工學院機械電氣工程系。2001年大學院系調整成立了機械電氣工程學院。石河子大學機械電氣工程學院辦學歷史悠久，治學嚴謹，具有優良的教風、學風和較強的學科實力。

機械電氣工程學院現有教職工120人，專職教師85人，其中正高職稱25人（博士生導師10人），副高職稱42人。具有博士學位33人，在讀博士18人，博士學歷占教師比例的40.74%。擁有中國工程院院士1人、國務院特殊津貼專家5人、省級教學名師4人、省級教學能手5人、省級有突出貢獻專家3人、兵團特設專家崗特聘專家1人、寶鋼優秀教師獎6人、省級各類人才5人。

機械電氣工程學院設有本科專業4個：農業機械化及其自動化、機械設計制造及其自動化、電氣工程及其自動化、工業工程。機械電氣工程學院擁有1個國家級特色專業（農業機械化及其自動化）、1個自治區“十三五”重點學科（農業工程學科）。擁有2個一級學科博士學位授權點（農業工程、機械工程），2個一級學科碩士學位授權點（農業工程、機械工程）；2個工程領域專業碩士學位授權點（農業工程、機械工程）和1個農業推廣領域碩士學位授權點（農業機械化）。機械電氣工程學院現有在校生1977人，其中本科生1683人，碩士261人、博士研究生33人。

機械電氣工程學院擁有良好的教學、科研條件，基礎設施完善，實驗儀器設備齊全。擁有特色作物生產機械裝備國家地方聯合工程實驗室（新疆兵團）、農業部西北農業裝備重點實驗室、教育部工程研究中心、省級重點實驗室、省級工程實驗室、自治區實驗教學示范中心、兵團職業技能鑒定站、校級實驗中心、CAD中心和圖書資料室。在中國一拖集團、天業集團、烏魯木齊金風天翼風電有限公司、昌吉特變電工、天富集團、紅山嘴電廠等企業建立了穩定的校外實習基地。